在土壤碳通量測量中，是否需要同時測量甲烷取決于研究目的和具體的測量方法。土壤碳通量通常指的是土壤與大氣之間的二氧化碳（CO₂）交換速率，而甲烷（CH₄）是另一種重要的溫室氣體，其產生和排放與土壤微生物活動密切相關。在某些情況下，研究者可能會同時測量CO₂和CH₄的通量，因為這兩種氣體的交換過程可能受到相似的環境因素影響，如溫度、濕度和土壤類型。

然而，并不是所有的土壤碳通量測量都需要同時考慮甲烷。例如，如果研究重點是評估土壤的CO₂排放，那么可能只需要專注于CO₂的測量，而不需要測量甲烷。此外，甲烷的測量通常需要特殊的設備和技術，因為甲烷的濃度相對較低，而且容易受到其他氣體的干擾。

在實際應用中，有些設備可以同時測量CO₂和CH₄的通量，如FG-809土壤碳通量測量系統，它可以用于土壤碳通量測量，并能提供關于甲烷通量的信息，同時還可以提供氧氣濃度、相對濕度、大氣壓力、PAR等環境信息和土壤溫濕度電導率等土壤測量信息。另一方面，一些設備可能專門設計用于測量CO₂通量，而不包含甲烷測量功能如FS-3080E。

總之，是否需要同時測量甲烷取決于研究的具體需求和試驗設計。在某些情況下，同時測量CO2和CH4可以提供更全面的土壤碳循環信息，但在其他情況下，單獨測量CO₂可能就足夠了。